Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Simc1E9Q6E9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Simc1E9Q6E9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms