Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BC005561E9Q5E2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms