Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdzd2E9Q1M1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pdzd2E9Q1M1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pdzd2E9Q1M1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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