Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp558E9Q1J0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp558E9Q1J0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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