Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdr1E9Q0B4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms