Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc1E9Q043 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc1E9Q043 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms