Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd2E9PZM4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd2E9PZM4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms