Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc28a1E9PXX9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc28a1E9PXX9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms