Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc8E9PWG2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc8E9PWG2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc8E9PWG2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms