Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3002E9PW72 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms