Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Piezo1E2JF22 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms