Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930444G20RikD3Z741 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms