Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
5430403G16RikD3Z5L4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms