Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5934D3Z4U6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms