Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms