Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd8B9EJ80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms