Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clip3B9EHT4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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