Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr3aB2RXC6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3aB2RXC6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3aB2RXC6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3aB2RXC6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3aB2RXC6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr3aB2RXC6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms