Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms