Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd34aB2RW11 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms