Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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