Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm4787B2RUD9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms