Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf1B2RRD7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms