Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf3B2RQG2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms