Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PtprsB0V2N1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PtprsB0V2N1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms