Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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