Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttll9A2APC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms