Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GabreA2AMW3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabreA2AMW3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms