Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmpd1A2AKB4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms