Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frmpd4A2AFR3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms