Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
4930447F04RikA2AFR2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms