Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calcoco2A2A6M5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Calcoco2A2A6M5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms