Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trav12-2A0N8N6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trav12-2A0N8N6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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