Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms