Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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