Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trbv21A0A0A6YX06 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trbv21A0A0A6YX06 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trbv21A0A0A6YX06 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trbv21A0A0A6YX06 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trbv21A0A0A6YX06 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv21A0A0A6YX06 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trbv21A0A0A6YX06 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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