Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms