Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Knop1Q9Z2Q2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms