Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd4Q9Z2D7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms