Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn8Q9Z260 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms