Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip6Q9Z1Y4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms