Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shcbp1Q9Z179 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shcbp1Q9Z179 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms