Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms