Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn9Q9Z0S7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn9Q9Z0S7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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