Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms