Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms