Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms