Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SnurfQ9WU12 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SnurfQ9WU12 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms