Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms