Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PplQ9R269 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PplQ9R269 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms